禽流感/新城疫病毒(AIV/NDV)荧光PCR试剂盒说明书
【产品名称】
商品名称:禽流感/新城疫病毒(AIV/NDV)核酸检测试剂盒(实时荧光-PCR法)
Name :Avian Influenza/Newcastle Disease Virus (AIV/NDV) Nucleic Acid Detection Kit (Real-time Fluorescence-PCR)
【包装规格】48T/盒
【预期用途】
禽流感是由A型流感病毒所引起的禽类疾病。AIV/除了感染禽类外,部分亚型也能够引起人感染或发病。野生水禽是禽流感病毒的自然宿主,一般对其不致病,当它们传染给其它物种时有时会造成大的发病率和死亡率。2013 年我国*报道了人感染 H7N9 型 AIV,至 2015 年有 571 例感染,212 人死亡。H7N9 AIV 对禽类表现低致病性,它引起家禽很轻微的或不引起临床症状,但对人却表现很高的致病性[1]。
本试剂盒适用于检测标本中的禽流感/新城疫病毒(AIV/NDV),适用于禽流感/新城疫病毒(AIV/NDV)感染的辅助诊断及流行病学调查。
【检验原理】
本试剂盒分别对禽流感AIV和新城疫病毒NDV设计特异性的引物和探针,用一步法荧光RT-PCR技术对AIV/NDV RNA进行体外扩增检测。
【试剂组成】
名 称 规 格
酶液 50μL×1 管
AIV-H7N9 反应液 1.0mL×1 管
AIV-H7N9 阳性质控品 50μL ×1 管
阴性质控品 250μL ×1 管
注:
1)不同批号试剂不能混用。
2)试剂盒内各试剂组份足够包装规格所标示的检测次数。
【储存条件及有效期】
-20℃±5℃,避光保存、运输、反复冻融少于 7 次,有效期 9 个月。
【适用仪器】
ABI 系列 、安捷伦 MX3000P/3005P 、MJ Opticon2 、Eppendorf 2/4 Color Systems、Bio-RadCFX96 等荧光定量 PCR 检测仪。
【标本采集】
病死或扑杀禽,取喉气管、脑、胸肌、心肌和肺等组织;待检活禽,用棉拭子取呼吸道分泌物或排泄物,置于 1mL 50%甘油生理盐水中。
【保存和运输】
上述标本短期内可保存于-20℃,长期保存可置-70℃,但不能超过 6 个月,标本运送应采用 2~8℃冰袋运输,严禁反复冻融。
【使用方法】
1.样品处理(样本处理区)
1.1样本前处理
每份组织分别从 3 个不同的位置称取样品约 1g,手术剪剪碎混匀后取 0.5g 于研磨器中研磨,加入 1.5mL 生理盐水后继续研磨,待匀浆后转至 1.5mL 灭菌离心管中, 8000rpm 离心 2min,取上清液 100μL 于 1.5mL 灭菌离心管中;棉拭子直接取 100 μL 提取。
1.2RNA 提取
推荐采用上海晅科生物科技有限公司生产的 RNA 提取试剂盒(离心柱提取法),请按照试剂盒说明书进行操作。
2.试剂配制(试剂准备区)
根据待检测样本总数,设所需要的 PCR 反应管管数为 N(N=样本数+1 管阴性对照+1 管阳性对照;样品每满 7 份,多配制 1 份),每测试反应体系配制如下表:
试剂 AIV-H7N9 反应液 酶液
用量 20μL 1μL
将混合好的测试反应液分装到 PCR 反应管中,21uL/管。
3.加样(样本处理区)
将步骤 1 提取的 RNA、阳性质控品、阴性质控品各取 4μL,分别加入相应的反应管中,盖好管盖,混匀,短暂离心。
4.PCR 扩增(核酸扩增区)
4.1将待检测反应管置于荧光定量 PCR 仪反应槽内;
4.2
设置好通道、样品信息,反应体系设置为 25μL;荧光通道选择: 检测通道
(Reporter Dye)FAM、CY5, 淬灭通道(Quencher Dye)选择 NONE,ABI 系列仪器请勿选择 ROX 参比荧光,选择 None 即可。
4.3推荐循环参数设置:
步骤 循环数 温度 时间 收集荧光信号
1 1cycle 42℃ 20min 否
2 1 cycle 95℃ 10min 否
3 40 cycle 94℃ 15sec 否
55℃ 30sec 是
5.结果分析判定
5.1结果分析条件设定
设置 Baseline 和 Threshold:一般直接按机器自动分析的结果分析,当曲线出现整体倾斜时,根据分析后图像调节 Baseline 的 start 值(一般可在 3~15 范围内调节)、stop 值(一般可在 5~20 范围内调节),以及 Threshold 的 Value 值(上下拖动阈值线至高于阴性对照),重新分析结果。
5.2结果判断
FAM 通道为禽流感病毒 H7N9 亚型 H7 基因检测结果,CY5 通道为禽流感病毒H7N9 亚型 N9 基因检测结果
阳性:检测通道 Ct 值≤35.0,且曲线有明显的指数增长曲线。
可疑:检测通道 Ct 值>35.0,且出现明显扩增曲线的样本建议重复试验,重复试验结果出现 Ct 值≤35.0 和明显扩增曲线者为阳性,否则为阴性。
阴性:样本检测结果无 Ct 值且无明显的扩增曲线。
6.检测方法的局限性
样本检测结果与样本收集、处理、运送以及保存质量有关;
样本提取过程中没有控制好交叉污染,会出现假阳性结果;
阳性对照、扩增产物泄漏,会导致假阳性结果;
病原体在流行过程中基因突变、重组,会导致假阴性结果;
不同的提取方法存在提取效率差异,会导致假阴性结果;
试剂运输,保存不当或试剂配制不准确引起的试剂检测效能下降,出现假阴性或定 量检测不准确的结果;
本检测结果仅供参考,如须确诊请结合临床症状以及其他检测手段。
7.质控标准
阴性质控品:无明显扩增曲线且无 Ct 值显示;
阳性质控品:扩增曲线有明显指数生长期,且 Ct 值≤32; 以上条件应同时满足,否则实验视为无效。
【注意事项】
所有操作严格按照说明书进行;
试剂盒内各种组分使用前应自然融化,*混匀并短暂离心;
反应液应避光保存;
反应中尽量避免气泡存在,管盖需盖紧;
使用一次性吸头、一次性手套和各区工作服;
样本处理、试剂配制、加样需在不同区进行,以免交叉污染;
实验完毕后用 10%次氯酸或 75%酒精或紫外灯处理工作台和移液器;
试剂盒里所有物品应视为污染物对待,并按照《微生物生物医学实验室生物安全通 则》进行处理。
【参考文献】
[1]Morens D M, Taubenberger J K, Fauci A S. H7N9 avian influenza A virus and the perpetual challenge of potential human pandemicity [J]. MBio,2013, 4(4): e00445-13.
[2]罗思思, 谢芝勋, 刘加波, 等. H7N9 亚型 AIV 双重实时荧光定量 RT-PCR 检测方法的建立[J]. 动物医学进展, 2013, 34(12):1-5.
[3]徐晓龙, 包红梅, 马 勇, 等. H7 和 N9 亚型及 A 型流感病毒多重荧光 RT-PCR 检测方法的建立[J].中国预防兽医学报, 2014, 12, 36: 939-942.
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